U prostorijama Fudbalskog saveza Federacije BiH održano je žrijebanje parova završnice juniorskog Kupa Federacije BiH za natjecateljsku sezonu 2025./2026.
U završnici juniorskog Kupa Federacije BiH sudjeluju pobjednici juniorskog Kupa kantonalnih nogometnih saveza, izuzev Nogometnog saveza Posavsog kantona Orašje.
U završnici juniorskog Kupa Federacije BiH sastaju se:
HNK TOMISLAV Tomislavgrad - NK RUDAR Kamengrad
NK STUPČANICA Olovo - FK VELEŽ Mostar
FK GORAŽDE - FK SLOBODA Tuzla/ OFK GRADINA Srebrenik
NK ROMARI Vitez/ NK ISKRA 1946 Bugojno - NK ŠIROKI BRIJEG
FK RADNIK Hadžići se direktno plasirao u završnicu Kupa Bosne i Hercegovine.
Utakmice završnice Kupa Federacije BiH za juniore igraju se 08.10.2025. godine.
Pobjednik Kupa Bosne i Hercegovine za juniore u prethodnoj natjecateljskoj sezoni bio je FK Željezničar Sarajevo.
| Zrinjski | 4 : 0 | Krupa |
| Čelik | 2 : 0 | Sloga |
| Radnik (H) | 0 : 1 | Željezničar |
| Slavija | 2 : 5 | Velež |
| Zvijezda 09 | 4 : 1 | Široki Brijeg |
| Sarajevo | : | Borac |
| Igman | 1 : 0 | Radnik |
| Željezničar Sport team | 1 : 0 | Sloboda |
| Poz | Tim | Utak | Pob | Ner | Por | Bod | |
| 1 | Borac | 13 | 10 | 1 | 2 | 31 | |
| 2 | Igman | 13 | 9 | 1 | 3 | 28 | |
| 3 | Zrinjski | 13 | 8 | 0 | 5 | 24 | |
| 4 | Sarajevo | 11 | 7 | 3 | 1 | 24 | |
| 5 | Zvijezda 09 | 13 | 7 | 3 | 3 | 24 | |
| 6 | Čelik | 14 | 7 | 1 | 6 | 22 | |
| 7 | Željezničar Sport team | 14 | 5 | 5 | 4 | 20 | |
| 8 | Sloga | 14 | 6 | 2 | 6 | 20 | |
| 9 | Široki Brijeg | 14 | 5 | 3 | 6 | 18 | |
| 10 | Krupa | 14 | 6 | 0 | 8 | 18 | |
| 11 | Željezničar | 14 | 5 | 1 | 8 | 16 | |
| 12 | Sloboda | 13 | 5 | 1 | 7 | 16 | |
| 13 | Velež | 13 | 4 | 1 | 8 | 13 | |
| 14 | Radnik | 14 | 3 | 3 | 8 | 12 | |
| 15 | Slavija | 13 | 3 | 2 | 8 | 11 | |
| 16 | Radnik (H) | 14 | 3 | 1 | 10 | 10 | |